BLAST介绍1BLAST2NCBIBLAST3PSIPHIBLAST4BLAST5BLASTBLASTNCBIBLASTBLAST+BLASTftp://ftp.ncbi.nlm.nih.gov/BLAST/executables/BLAST+/LATEST/BLAST②调取DOS命令③到达BLAST的bin目录下④建库⑤比对BLASTFTPBLASTBLASTBLASThttps://www.ncbi.nlm.nih.gov/books/NBK52637/DOSwindows+Rcmd‖BLASTBLASTbin:cd[:][][]:―cd\‖——―cd..‖——cd‖BLASTbin“cd”BLASTBLASTbincd‖BLASTbinC:\ProgramFiles\NCBI\BLAST-2.7.1+\binD...
BLAST介绍1BLAST2NCBIBLAST3PSIPHIBLAST4BLAST2BLASTBLASTBLASTPCRNeedleman-WunschTPubChemBioAssayBLASTSmartBLAST找到与查询高度相似的蛋白质针对特定PCR模板设计引物双序列全局比对(Needleman-Wunsch)在序列中查找保守的域查找基因表达谱的匹配项搜索免疫球蛋白和T细胞受体序列搜索序列的载体污染查找具有类似保守域的序列搜索用于系统发育分析的标记使用结构域和蛋白质限制进行多序列比对在PubChemBioAssay中搜索蛋白质...
BLAST介绍1BLAST2NCBIBLAST3PSIPHIBLAST4BLAST5BLASTPSI-BLASTPSI-BLASTPositionSpecificIterativeBLASTBLASTPPSSM(position-specificscoringmatrix)0BLASTPSI-BLASTYY1PSI-BLAST1PSI-BLAST2PSSMPSI-BLAST342516PHI-BLASTPHI-BLASTPattern-HitInitiatedBLASTBLASTPatternPSI-BLASTYY1PHI-BLASTPROSITESCANhttps://npsa-prabi.ibcp.fr/cgi-bin/npsa_automat.pl?page=/NPSA/npsa_proscan.htmlYY1FASTAC2H2PHI-BLASTIUPACx[]{},-<N...
BLAST介绍•••••megaBLAST•discontinuousmegaBLAST•BLASTn7•BLASTP•PSI-BLASTPositionSpecificIterativeBLASTBLAST•PHI-BLASTPattern-HitInitiatedBLASTBLAST•DELTA-BLASTPSSMBLOSUM62BLASTCompositionaladjustmentsE
生物序列的相似性搜索-BLAST简介及其应用2010年6月科教信息科2序列数据的保存格式与相关数据库资源在数据库中进行序列相似性搜索多序列比对进化树构建与分子进化分析Motif的寻找与序列的模式识别RNA二级结构,蛋白质二、三级结构的预测基因芯片的数据分析生物信息学常见的应用与软件3内容提要1.基本概念相似性,同源性2.BLAST介绍BLAST资源和相关问题3.BLAST的应用网络版,单机版4.深入了解BLAST(改进程序,算法...
生物序列的相似性搜索-BLAST简介及其应用2005年3月2序列数据的保存格式与相关数据库资源在数据库中进行序列相似性搜索多序列比对进化树构建与分子进化分析Motif的寻找与序列的模式识别RNA二级结构,蛋白质二、三级结构的预测基因芯片的数据分析生物信息学常见的应用与软件3内容提要1.基本概念相似性,同源性2.BLAST介绍BLAST资源和相关问题3.BLAST的应用网络版,单机版4.深入了解BLAST(改进程序,算法基础)5.其...
序列比对基础与序列比对基础与BLASTBLAST入门入门序列比对基础与序列比对基础与BLASTBLAST入门入门序列比对序列比对基础与基础与BLASTBLAST入门入门教材教材PagePage6868,,第五章第五章本次课重点讲本次课重点讲BLASTBLAST的使用的使用下次理论课对本次课的内容进行总结、补充和下次理论课对本次课的内容进行总结、补充和深化深化YourtruevaluedependsentirelyonwhatYourtruevaluedependsentirelyonwhatyouarecomparedw...