BLAST介绍•••••megablast•discontinuousmegablast•blastn7•BLASTP•PSI-BLASTPositionSpecificIterativeBLASTBLAST•PHI-BLASTPattern-HitInitiatedBLASTBLAST•DELTA-BLASTPSSMBLOSUM62BLASTCompositionaladjustmentsE
NCBI中重要子库介绍—GeneGeneNCBIGeneGeneHomehttps://www.NCBI.nlm.nih.gov/gene/GeneGeneIDYY122632GeneYy1MGIYY1MGIMGIMGI:99150Ensembl:ENSMUSG00000021264YY-1;NF-E1Yy1MGIYY1MGIMGIMGI:99150Ensembl:ENSMUSG00000021264YY-1;NF-E1MouseGenomeInformaticsInternationalMouseStrainResource(IMSR)Yy1MGIYY1MGIMGIMGI:99150Ensembl:ENSMUSG00000021264YY-1;NF-E1EnsemblTaxonomy12F11259.586PubMed551010VariationNCBIdbSNP50bpdbVarClinVarClinVarYy1Yy1GONCBImRNANCBImRNATranscriptVariantisoform
NCBI中重要子库介绍—GenBank和RefSeqGenBankGenBankGBFFGBFF(GenBankflatfile,GBFF)GBFFGenBankGenBankGenBankGenBankGenBank(GenBankDivision)GenBank1PRIprimatesequences2RODrodentsequences3MAMothermammaliansequences4VRTothervertebratesequencs5INVinvertebratesequences6PLNPlants,fungal,andalgalsequences7BCTbacterialsequences8VRLviralsequences9PHGbacteriophagesequencesGenBank(GenBankDivision)GenBank10SYN...
NCBI中重要子库介绍—GenBank和RefSeqGenBank2018121ESTGSSNCBINucleotideGenBankhttps://NCBIinsights.NCBI.nlm.nih.gov/2018/07/30/upcoming-changes-est-gss-databases/）GenBankESTExpressedSequenceTagsGSS（GenomeSurveySequences）NucleotideGenBankGenBankhttps://www.NCBI.nlm.nih.gov/genbank/GenBankGenBankGenBankACCESSIONVERSIONGenInfoIdentifier，GIAccessionNumberGenBankEMBLDDBJaccession.versionftp://ftp....
生物学数据库及其检索NCBI数据库与数据资源NCBINCBINCBI中重要子库介绍—PubMedPubMedhttp://www.NCBI.nlm.nih.gov/PubMedPubMed生物医学和健康领域生命科学行为科学化学科学生物工程PubMed①基本检索功能②辅助检索功能③NCBI的个性化信息服务https://www.NCBI.nlm.nih.gov/books/NBK3827/#pubmedhelp.PubMed_Quick_StartPubMedYY1YY1ANDShiY“mouseYY1”decidua*YY1[TI]作者检索[AU]ShiY[AU]Affiliation[AD]ArticleIdentifier...
生物学数据库及其检索NCBI数据库与数据资源NCBINCBINCBI概述NCBIEntrezEntrezNationalCenterforBiotechnologyInformationNCBIhttps://www.NCBI.nlm.nih.govNCBINationalInstitutesofHealthNIH(NationalLibraryofMedicineNLM)NCBIhttps://www.NCBI.nlm.nih.gov/books/NBK3831/NCBINCBIhttps://www.NCBI.nlm.nih.gov/books/NBK143764/NCBIhttps://www.NCBI.nlm.nih.gov/books/NBK21106/def-item/NCBINCBIEntrezEntrezNCBIEntrezht...
NCBI网站介绍www.NCBI.nlm.nih.gov黄利辉NationalCenterforBiotechnologyInformationNCBI网站简介1988年，美国的参议员ClaudePepper发起1988年11月4日通过立法建立国立生物技术信息中心NCBI的任务:建立基于计算机的信息处理的关于分子生物学，生物化学，和遗传学知识的存储和分析的自动系统。并进行先进方法的研究。促进生物技术研究者和医药治疗人员对数据库和软件的使用。促进全世界范围内的生物技术信息收集的合作NCBI生物信...
利用ORFfinder（NCBI）搜索E.coli部分基因组序列上的ORF•当一个新基因被识别，其DNA序列被解读，我们能搞清相应的蛋白序列是什么吗？•那么我们怎么样能知道相应的蛋白序列是什么呢？•在没有其它信息的前提下，DNA序列可以按六种框架阅读和翻译（每条链三种，对应三种不同的起始密码子）。ORF识别包括检测这六个阅读框架并决定哪一个包含以启动子和终止子为界限的DNA序列而其内部不包含启动子或终止子，符合这些条件的序列有...
