多序列比对(SNPs)①动态规划算法(DynamicProgrammingAlgorithm)②渐进的多序列比对(ProgressiveMultipleAlignments)③迭代法(IterativeMethods)④基于一致性的方法(HiddenMarkovModelHMM)s=ATGCt=ATGTTATw=ATCGTAC+p（―，tj）di-1,jdi-1,j-1di,j-1di,j+p（si，―）SSi,j,k①②③④⑤⑥⑦
动态规划算法局部比对和实例----AGCT----ATGCAGCTGCTTSmith-Waterman),(,)(),(max1,,11,1,jjiijijijijitpdpsdpstddd0,0=0Globalalignment),(,)(),(max1,,11,1,jjiijijijijitpdpsdtpsddd0,0=00Localalignment0ATTCCATTCGA01234564-3-4012345sATTCCAtTTCGAACTTCGACTAGATTCCA0TTCGA01234564-3-4012345+p（―，tj）di-1,jdi-1,j-1di,j-1di,j+p（si，―）0ACTTCGACTAGA...
动态规划算法——全局比对实例ACTTCGACTAG01234563-1-2012345sACTTCGtACTAGACTTCGACTAGACTTCG0ACTAG01234563-1-2012345+p（―，tj）di-1,jdi-1,j-1di,j-1di,j+p（si，―）ACTTCG0-2ACTAG+p（―，tj）di-1,jdi-1,j-1di,j-1di,j+p（si，―）3-1-20123456012345ACTTCG0-2-4-6-8-10-12ACTAG+p（―，tj）di-1,jdi-1,j-1di,j-1di,j+p（si，―）3-1-20123456012345ACTTCG0-2-4-6-8-10-12A-2CTAG+p（―，tj）di-1,jdi-1,j-1di,j-1di,j+p...
双序列比对动态规划算法300ATTCCGAAGAAGTCGAAGGT2300——(DynamicProgrammingAlgorithm)►Needleman-Wunsch►Smith-WatermanC1C2W1W21C1+w12C2+w2ATTCCGAAGAAGTCGAAGGTATTCCGAAGAGTCGAAGGAT+-T+A+-stmns0s1s2si-1sisi+1smt0t1t2tj-1tjtj+1tnsitjsi--tj0s1s2si-1sisi+1sm0t1t2tj-1tjtj+1tn0s1s2si-1sisi+1sm0t1t2tj-tj+1tn0s1s2si-si+1sm0t1t2tj-1tjtj+1tnS0:s:i0:t:j0:s:i0:t:j0:s:i0:t:j)(,):,:...
第七章动态规划规划问题的最终目的就是确定各决策变量的取值，以使目标函数达到极大或极小。在线性规划和非线性规划中，决策变量都是以集合的形式被一次性处理的；然而，有时我们也会面对决策变量需分期、分批处理的多阶段决策问题。所谓多阶段决策问题是指这样一类活动过程：它可以分解为若干个互相联系的阶段，在每一阶段分别对应着一组可供选取的决策集合；即构成过程的每个阶段都需要进行一次决策的决策问题。将各个阶段的...
算法综合实验报告学号：1004111115姓名：李宏强一、实验内容：分别用动态规划、贪心及分支限界法实现对TSP问题（无向图）的求解，并至少用两个测试用例对所完成的代码进行正确性及效率关系上的验证。二、程序设计的基本思想、原理和算法描述：（包括程序的数据结构、函数组成、输入/输出设计、符号名说明等）1、动态规划法(1)数据结构：①利用二进制来表示集合，则集合S可由一个十进制数x相对应，此x所对应的二进制数为y，如果y...
-56-第四章动态规划§1引言1.1动态规划的发展及研究内容动态规划（dynamicprogramming）是运筹学的一个分支，是求解决策过程（decisionprocess）最优化的数学方法。20世纪50年代初R.E.Bellman等人在研究多阶段决策过程(multistepdecisionprocess)的优化问题时，提出了著名的最优性原理（principleofoptimality），把多阶段过程转化为一系列单阶段问题，逐个求解，创立了解决这类过程优化问题的新方法—动态规划。1957年出版了他...
